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人体由不同基因组组成的马赛克图片(人体由不同基因组组成的马赛克有哪些)

Time:2024-06-15 07:46:20 Read:210 作者:CEO

研究发现正常人体组织充满突变。

一项针对29 种不同组织的大规模研究发现,人体是由具有不同基因组的不同细胞组成的复杂镶嵌体,其中许多细胞含有可能导致癌症的突变。

人体由不同基因组组成的马赛克图片(人体由不同基因组组成的马赛克有哪些)

皮肤比人体其他组织具有更高程度的镶嵌性。

这项研究是迄今为止规模最大的同类研究,包括来自约500 人的数千个样本。研究结果发表于6 月6 日期刊《科学》 [Yizhak, K. et al. Science364, eaaw0726 (2019)],可以帮助科学家更好地了解癌症是如何发生的以及如何更早地发现它。

我们现在认识到,人体实际上是一个嵌合体,我们体内的大量细胞天生就携带着癌症突变。英国威康桑格研究所的遗传学家伊尼戈·马丁科雷纳表示,这些突变是癌症的种子。

组织嵌合现象是细胞内突变积累的结果。其中一些突变来自细胞分裂过程中潜入的DNA 错误,还有一些是由于暴露于紫外线或香烟烟雾等环境因素造成的。当具有特定突变的皮肤细胞分裂时,它产生的皮肤在基因上与周围的皮肤不同。

先前的研究通常通过对显微组织样本中的特定基因进行测序,发现皮肤、食道和血液中存在较高水平的嵌合体。

复杂的图案

这些发现引起了美国马萨诸塞州总医院计算生物学家Gad Getz 的注意。他和他的团队决定采取不同的策略:他们不是对微小样本的DNA 进行测序,而是挖掘基因型组织表达(GTEx) 项目的RNA 序列数据库。由于身体在制造RNA序列时使用DNA作为模板,因此DNA中的突变可能会反映在RNA中。

在靶向RNA 后,Getz 和他的同事很快从约500 人29 个组织的6,700 个样本中获得了数据。但他们的方法也有缺点。由于并非所有DNA 都编码RNA,因此并非所有DNA 突变都会出现在RNA 序列中。此外,GTEx项目中使用的样本相对较大,具有独特基因组的小细胞群的DNA特征可能会被大量其他细胞所淹没。

总体而言,研究发现某些组织中嵌合的实际水平低于之前研究的预期。但马丁科雷纳说,关键是新的分析表明镶嵌现象存在于多种组织中。

细胞分裂率高的组织,例如构成皮肤和食道的组织,往往比细胞分裂率低的组织更容易出现嵌合现象。此外,镶嵌现象随着年龄的增长而增加,并且在肺部和皮肤中尤其普遍。这些组织经常暴露于可能损害DNA 的环境因素中。

信号微弱

一种名为TP53的基因可以帮助修复DNA损伤,被称为基因组的守护者。它也是最常见的突变位点之一。 TP53 的某些变化与癌症相关,但肿瘤的形成需要其他突变。

我们现在看到的是一些最早的癌前变化,然后积累更多的突变。加拿大不列颠哥伦比亚省癌症研究所的癌症基因组学研究员Erin Pleasance 表示,最终,这些突变中的一小部分可能会发展成癌症。

美国约翰·霍普金斯大学医学院的应用数学家克里斯蒂安·托马塞蒂表示,研究人员现在需要找到方法来区分哪些细胞会变成肿瘤,哪些细胞是正常的。这对于改善癌症的早期检测起着至关重要的作用。

Tomasetti开发的一种新方法可以检测血液中循环的肿瘤DNA,研究人员希望这种方法将来可以用于检测癌症的早期迹象。但他表示,研究小组对他们最初在一组正常血细胞中发现的突变感到惊讶。这些突变与癌症相关,因此可能表明肿瘤的存在。

这种混乱已经成为新常态,托马塞蒂表示,现在的挑战是弄清楚什么混乱可以被视为正常。

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